작성일 : 2019. 3. 27. DNA, RNA, 단백질 시퀀싱 등에서 발생하는 변이를 variants, mutations or polymorphisms 라고 부른다. 이런 용어의 혼동을 예방하고자 나온 표기법이 HGVS 명명법이다. 출처 : http://varnomen.hgvs.org/bg-material/simple/ The format of a complete variant description is reference:description, e.g.; *NM_004006.2:c.4375C>T *NC_000023.11:g.32389644G>A All variants are described in relation to a reference, the so called reference sequence,..

작성일 : 2017. 8. 1. Samtools VCFtools

작성일 : 2018. 5. 17. M$ 윈도에 WSL (윈도우 서브시스템 리눅스) 를 활성화하려면 Windows 10 Pro? 이상부터 가능하다고 알고 있었다. 설정 -> 개발자 모드 켜기 ... (내 OS는 HOME 인데, 시도도 못하는구나...!) ㅋㅋㅋ 그런데, 아니었다. 초기에는 Ubuntu BASH on Windows (즉, 우분투의 캐노니컬과 마소가 제휴를 해서 우분투에서 돌아가는 BASH 를 윈도에서 쓸 수 있게) 만 가능했지만, 이제는 Microsoft Store 에서 이렇게 WSL 화된 배포판을 골라서 설치할 수 있게 되었다. 0. [준비] 파워쉘을 관리자 권한으로 실행하고 다음 명령으로 WSL 을 활성화한다. [WSL 설치 진행 막대] (WSL 을 기존에 설치한 적이 있다면 다음과 같이..

작성일 : 2020. 12. 5. 요즘 Python 과 PHP 를 함께 보다 보니 json_dump(), print_r() 등 헷갈리는 게 한 두 가지가 아니다. 요 며칠 전에 Docker 에서 Compose 를 보았는데, PHP 에도 이름과 기능이 유사한 Composer 유틸리티가 있다. java 로 치면 Maven, Gradle 같은 존재인가 보다. 참고 문서 : getcomposer.org/download/

작성일 : 2021. 9. 15. 사용법) 상위 디렉토리에서 전체 프로젝트에 대해 활성화된 로컬 브랜치를 확인하려고 할 때 [/mnt/d/backend]$ git_branch.sh repoPrj0 -> * dev repoPrj1 -> * newDev repoPrj2 -> * dev 프로젝트 디렉토리에서 로컬 브랜치 목록을 확인할 때 [/mnt/d/backend/repoPrj1]$ git_branch.sh dev * newDev oldWork 스크립트 소스) #!/bin/bash # Copyright [2021-2022] [한정훈 & papercraft.tistory.com & 종이와 쉼터] # # Licensed under the Apache License, Version 2.0 (the "License..

작성일 : 2021. 9. 15. 프로젝트 디렉토리 구조가 다음과 같을 때 각각의 디렉토리로 들어가서 git fetch && git pull 을 실행하는 스크립트다. 로컬 브랜치마다 업데이트를 하고 보여줘야 하기 때문에 git branch 명령도 활용한다. 최상위 디렉토리 (Workspace) 하위 프로젝트 디렉토리 비고 /mnt/d/backend /repoPrj0 .git 존재 /repoPrj1 .git 존재 /repoPrj2 .git 존재 굳이 IDE 에서 마우스로 연속된 클릭 동작으로 안하고 힘들게 하냐고 묻는 사람이 있다. 하지만, 한 번에 처리하는 게 편하거든. VsCode 띄워놓고 [새로 고침], [Pull], ... 언제 다 누르냐고, 그것도 성가시게 프로젝트마다 눌러가면서 말이지. 사용법)..